RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BGRLO75368 114 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ETHE1O95571 254 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PGRP06401 933 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ASGR2P07307 311 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRPS2P11908 318 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PCNAP12004 261 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1B2P21281 511 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN8P56748 225 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 RHDQ02161 417 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 E2F2Q14209 437 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SF1Q15637 639 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TRIP10Q15642 601 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 IFNEQ86WN2 208 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 HID1Q8IV36 788 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MRGPRX1Q96LB2 322 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRO3102Q9H379 93 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ALG2Q9H553 416 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 VPS29Q9UBQ0 182 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.01■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 IL6P05231 212 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GPR89BP0CG08 455 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GSK3BP49841 420 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 LIPEQ05469 1076 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF33BQ06732 778 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PWP1Q13610 501 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT13Q8IUC8 556 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 HUS1BQ8NHY5 278 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 WDR37Q9Y2I8 494 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa22■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CEACAM5P06731 702 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V1C1P21283 382 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KELP23276 732 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SOX11P35716 441 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CLCNKAP51800 687 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MAPKAPK3Q16644 382 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 LILRA2Q8N149 483 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 OR5K2Q8NHB8 316 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GTF2H4Q92759 462 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CGREF1Q99674 301 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PREBQ9HCU5 417 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SCML1Q9UN30 329 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 USP22Q9UPT9 525 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 LRATO95237 230 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CD72P21854 359 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK1P28482 360 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GRIA3P42263 894 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SELPLGQ14242 412 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MED27Q6P2C8 311 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 FCRL1Q96LA6 429 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 LRGUKQ96M69 825 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PIF1Q9H611 641 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PPT2Q9UMR5 302 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.99■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KCNH1O95259 989 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 ACADSP16219 412 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MTPNP58546 118 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PHC1P78364 1004 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 BNIP2Q12982 314 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 DNASE1L2Q92874 299 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO4A1Q96BD0 722 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 OR52E6Q96RD3 313 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 PKP2Q99959 881 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 APOOQ9BUR5 198 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 VAPAQ9P0L0 249 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 MCM8Q9UJA3 840 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 RIMS3Q9UJD0 308 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 FZD4Q9ULV1 537 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 KCNK6Q9Y257 313 aa21.98■■□□□ 1.11
VSTM4-201ENST00000298454 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.98■■□□□ 1.11
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