RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 C6P13671 934 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.212e-6■■□□□ 11.7
SLC13A3-202ENST00000290317 CENPAP49450 140 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PTSQ03393 145 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HPS6Q86YV9 775 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PDPRQ8NCN5 879 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MZB1Q8WU39 189 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HMGB4Q8WW32 186 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SNX19Q92543 992 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 KIAA1191Q96A73 305 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 NELL2Q99435 816 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PSD2Q9BQI7 771 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 OPTCQ9UBM4 332 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 POMPQ9Y244 141 aa7.51□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC31A1O15431 190 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF254O75437 659 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CLPXO76031 633 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PRSS56P0CW18 603 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CBX5P45973 191 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CDKN2DP55273 166 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CNTN1Q12860 1018 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ABRQ12979 859 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PEX6Q13608 980 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 KCNC3Q14003 757 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CCNIQ14094 377 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PTPRRQ15256 657 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 NPTX1Q15818 432 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 OR2AG1Q9H205 316 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 IQCF5A8MTL0 148 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 H3BM21 787 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 DYRK3O43781 588 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 KERAO60938 352 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MTX2O75431 263 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ASGR2P07307 311 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 C8GP07360 202 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 EVI2BP34910 448 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ALDH3B2P48448 385 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SERPINB10P48595 397 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 KIF19Q2TAC6 998 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RHEBL1Q8TAI7 183 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 S100ZQ8WXG8 99 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HDAC8Q9BY41 377 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HOXD1Q9GZZ0 328 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 H3BMQ9 156 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HDAC3O15379 428 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PDPK1O15530 556 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MBTPS2O43462 519 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 NPHS1O60500 1241 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 APOA1P02647 267 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 PKLRP30613 574 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RRM2P31350 389 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 HPCAL1P37235 193 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ETV4P43268 484 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 RPIAP49247 311 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 ADGRE1Q14246 886 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.5□□□□□ -1.21
SLC13A3-202ENST00000290317 DEFB123Q8N688 67 aa7.5□□□□□ -1.21
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