RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 KLHL20Q9Y2M5 609 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 DRD4P21917 467 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CCND1P24385 295 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SERPINB3P29508 390 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CHIT1Q13231 466 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NKAIN2Q5VXU1 208 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC74AQ96AQ1 378 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PHOX2BQ99453 314 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ACTR8Q9H981 624 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 HRASLS2Q9NWW9 162 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 TIMM22Q9Y584 194 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 KCNE2Q9Y6J6 123 aa25.17■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PIPSLA2A3N6 862 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CPED1A4D0V7 1026 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NRP2O60462 931 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 UBXN7O94888 489 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 OTCP00480 354 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CD22P20273 847 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PRKAA1Q13131 559 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NR0B2Q15466 257 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 XKR6Q5GH73 641 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ICE2Q659A1 982 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SLC5A11Q8WWX8 675 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 UCK1Q9HA47 277 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ACTR10Q9NZ32 417 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SPEGQ15772 3267 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa25.16■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 OR5K3A6NET4 321 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 LILRA5A6NI73 299 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ESRRBO95718 433 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF883P0CG24 379 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 GLB1P16278 677 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 UGT2B7P16662 529 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 DOC2AQ14183 400 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 OR2A14Q96R47 310 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 EPN3Q9H201 632 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SPNS1Q9H2V7 528 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NPHS2Q9NP85 383 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 KCNK4Q9NYG8 393 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 FFAR3O14843 346 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CLGNO14967 610 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 GPR42O15529 346 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 GNAZP19086 355 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NAA20P61599 178 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 IRF8Q02556 426 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SF1Q15637 639 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 CSRP2Q16527 193 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 PERM1Q5SV97 790 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 FAM181AQ8N9Y4 354 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 HAUS8Q9BT25 410 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 NTMT1Q9BV86 223 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 KLHL25Q9H0H3 589 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 SLC6A20Q9NP91 592 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.15■■□□□ 1.62
TOMM40-201ENST00000252487 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PROS1P07225 676 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 AMD1P17707 334 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 TGM1P22735 817 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 RPL14P50914 215 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PKNOX1P55347 436 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 AMZ1Q400G9 498 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 C17orf64Q86WR6 236 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 OOSP2Q86WS3 158 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 OR2L3Q8NG85 312 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 GPRC5BQ9NZH0 403 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 HAO1Q9UJM8 370 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa25.14■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 GIPC1O14908 333 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 AZIN1O14977 448 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 CRCPO75575 148 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 CLDN9O95484 217 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 CAPN1P07384 714 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 LSSP48449 732 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 KIR2DS3Q14952 304 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PROX2Q3B8N5 592 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 MAVSQ7Z434 540 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 RFWD2Q8NHY2 731 aa25.13■■□□□ 1.61
TOMM40-201ENST00000252487 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms