RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219794.10

BCKDK-201, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDK, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-201ENST00000219794 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.33■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.33■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.33■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.33■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ENTPD5O75356 428 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ZNF217O75362 1048 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CAPN3P20807 821 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ZNF33BQ06732 778 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TCEA2Q15560 299 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 REPS1Q96D71 796 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CDRT15Q96T59 188 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 NELL2Q99435 816 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 EBF2Q9HAK2 575 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CCDC154A6NI56 674 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 H0YIV9 168 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 IGHV4-34P06331 123 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ZP2Q05996 745 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PCDH1Q08174 1060 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 LRP8Q14114 963 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 MED27Q6P2C8 311 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 Q6ZSR6 202 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PACS2Q86VP3 889 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 LIX1Q8N485 282 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 STMN2Q93045 179 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TEX37Q96LM6 180 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ZBTB18Q99592 522 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HAUS8Q9BT25 410 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.32■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 FAM234BA2RU67 622 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RASGRP1O95267 797 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PSME3P61289 254 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RCAN2Q14206 197 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CLCA4Q14CN2 919 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 LCTLQ6UWM7 567 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RNF175Q8N4F7 328 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TSPEARQ8WU66 669 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RLN3Q8WXF3 142 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 BIRC7Q96CA5 298 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CROTQ9UKG9 612 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.31■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SERTM1A2A2V5 107 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 MAPK1P28482 360 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CASP2P42575 452 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RABIFP47224 123 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ATG9BQ674R7 924 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HPS6Q86YV9 775 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ADA2Q9NZK5 511 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 DMTF1Q9Y222 760 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TOR1BO14657 336 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TNFRSF10CO14798 259 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ERGP11308 486 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 MTTPP55157 894 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 FZD5Q13467 585 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 HID1Q8IV36 788 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 SMPDL3AQ92484 453 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ROPN1LQ96C74 230 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 DPY30Q9C005 99 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 ASIC5Q9NY37 505 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TAC3Q9UHF0 121 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.3■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 A0A1W2PP18 115 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PRPH2P23942 346 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CTBSQ01459 385 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 LAPTM5Q13571 262 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 PTGR1Q14914 329 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 CYP2A13Q16696 494 aa20.29■□□□□ 0.84
BCKDK-201ENST00000219794 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms