RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030690.11

Cdca8-201, Transcript of Borealin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cdca8, Length 1,264 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Lhx6Q9R1R0 363 aa9.49□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Bod1lE9Q6J5 3032 aa9.49□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Zfhx3Q61329 3726 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Chst13D3Z6E3 336 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Erich1E9PY43 332 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ap1arE9PYF7 298 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Susd5G3UW60 619 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Gm21976J3QNN2 249 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Vmn2r4K7N784 913 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Fam71e2L7N480 754 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Agpat1O35083 285 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Foxd2O35392 492 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Kcnk4O88454 398 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Tpst2O88856 376 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 P18533 117 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Myf5P24699 255 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 PnmtP40935 295 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 ThraP63058 492 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Gbp8Q2V6D6 525 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Sec31bQ3TZ89 1158 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Foxk2Q3UCQ1 651 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 OmpQ64288 163 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Cep78Q6IRU7 790 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 DdiasQ6NZG4 898 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 CebpeQ6PZD9 281 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 PrlhrQ6VMN6 370 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Uts2bQ765I1 113 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Olfr293Q7TS10 336 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Clec18aQ7TSQ1 534 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Znf32Q80V23 272 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Eme1Q8BJW7 570 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Cdcp2Q8BQH6 427 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Peli3Q8BXR6 445 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Calcoco1Q8CGU1 691 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Mrpl47Q8K2Y7 252 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ccm2Q8K2Y9 453 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Adam32Q8K410 754 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Retreg1dQ8VE91 480 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Olfr315Q8VFG7 309 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Olfr347Q8VGK2 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Lgals12Q91VD1 314 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Hdac11Q91WA3 347 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Cdkal1Q91WE6 578 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Pcdhb4Q91XZ6 784 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Unc50Q9CQ61 259 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Asf1aQ9CQE6 204 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Gm26657Q9CVR1 127 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Slc52a3Q9D6X5 460 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Tmigd1Q9D7L8 261 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Reg4Q9D8G5 157 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Olfr630Q9EQQ7 319 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Pin1Q9QUR7 165 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Copg1Q9QZE5 874 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Stat2Q9WVL2 923 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Eif2s3xQ9Z0N1 472 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Lactbl1S4R213 581 aa9.48□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Cfap46E9Q2C0 2641 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 FcmrA1KXC4 422 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 FanceB8JJD6 213 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Vmn2r34E9PVI0 852 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Zscan4bE9Q3G0 505 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Vmn2r37F8VQD3 802 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Gm20878L7N244 103 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Serpinb6bO08804 377 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 E2f3O35261 457 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 ArafP04627 604 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 P2ry2P35383 373 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Id4P41139 161 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Nanos3P60324 178 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 NficP70255 439 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ext2P70428 718 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Prss38Q3UKY7 322 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Taar7dQ5QD10 358 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 E2f1Q61501 430 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Ifi47Q61635 420 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Six3Q62233 333 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Fam189a1Q6A044 515 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 AY358078Q6UY53 465 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Scn4bQ7M729 228 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Eml2Q7TNG5 649 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 PeloQ80X73 385 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Q8BGA7 448 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Arhgap19Q8BRH3 494 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa9.47□□□□□ -0.89
Cdca8-201ENSMUST00000030690 Zhx3Q8C0Q2 951 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms