RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs5O54928 536 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btnl2O70355 454 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01679 107 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr5bP31387 370 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab8aP55258 207 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q5EBG8 199 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga2Q62469 1178 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbl1Q64701 1063 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppm1nQ8BGL1 404 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Piwil2Q8CDG1 971 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc45a3Q8K0H7 553 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr330Q8VGD9 315 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nipal2Q91WC7 383 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem98Q91X86 226 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gjd3Q91YD1 278 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scd3Q99PL7 359 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb11Q9CQV3 388 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hm13Q9D8V0 378 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hs6st1Q9QYK5 411 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E9Q0B3 247 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer4cG3UXD1 256 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10354K7N6A0 256 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc153P0C7Q1 202 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Etv4P28322 485 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntsr2P70310 416 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pros1Q08761 675 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WhammQ571B6 793 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt72Q6IME9 520 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dalrd3Q6PJN8 538 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubp1Q811S7 540 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abi3Q8BYZ1 367 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BicralQ8CHH5 1074 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IlkapQ8R0F6 392 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgpra2Q91WW4 305 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhga4Q91XY4 930 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr6Q99ME2 1125 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldnd1Q9CQX5 253 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps33Q9D2R8 106 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SqorQ9R112 450 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa12.33□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr663A0A1B0GSI9 319 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga8A2ARA8 1062 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14459A2BI73 179 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf11cB4XVP9 339 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20671F6TVX7 576 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc149F6V035 524 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8011K7N6Y5 207 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JunbP09450 344 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcmt1P23506 227 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps26aP40336 327 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TigitP86176 249 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CdonQ32MD9 1250 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gngt2Q61017 69 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CilpQ66K08 1184 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr765Q7TRI6 309 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex13c3Q810P0 219 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wbp1lQ8BGW2 348 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tyw1Q8BJM7 721 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r198Q8R263 300 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr183Q8VFB9 309 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr767Q8VG33 309 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fig4Q91WF7 907 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Basp1Q91XV3 226 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt12Q920N7 421 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstt3Q99L20 241 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppil6Q9D6D8 278 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcne5Q9QZ26 143 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1153A2AVC0 318 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TriqkB2B9E1 86 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncam2O35136 837 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01664 111 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PfklP12382 780 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccr7P47774 378 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapk10Q61831 464 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UnkQ8BL48 810 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpat3Q8C0N2 438 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tram1l1Q8QZR0 363 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AassQ99K67 926 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClpsQ9CQC2 113 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CutalQ9D1U5 156 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfap54Q8C6S9 3106 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dock6Q8VDR9 2080 aa12.32□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa12.31□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam166bA2AIP0 273 aa12.31□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgr4A2ARI4 951 aa12.31□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp992B1ASD8 573 aa12.31□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa12.31□□□□□ -0.44
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgbd1E9Q492 415 aa12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms