RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CDH18Q13634 790 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 KYAT1Q16773 422 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A52Q3SY17 297 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MILR1Q7Z6M3 343 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SYVN1Q86TM6 617 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TMCO6Q96DC7 493 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 FAM83DQ9H4H8 585 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PIGVQ9NUD9 493 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MCUBQ9NWR8 336 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DDIT4Q9NX09 232 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MKLN1Q9UL63 735 aa8□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 E9PAM4 449 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 AZIN1O14977 448 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SYN3O14994 580 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJB5O75953 348 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A27O95847 323 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ITGB1P05556 798 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SSTR2P30874 369 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC19A1P41440 591 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3CBP42338 1070 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TKTL1P51854 596 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 UGT2B15P54855 530 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 HUNKP57058 714 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 GRIK4Q16099 956 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 GTDC1Q4AE62 458 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC190Q86UF4 302 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD6Q96NE9 622 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MFRPQ9BY79 579 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN24A6NM45 220 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA12O60330 932 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PTHP01270 115 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PROS1P07225 676 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 STSP08842 583 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 KELP23276 732 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 KIR2DL3P43628 341 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PGFP49763 221 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DGKEP52429 567 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MAP2K6P52564 334 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 HYAL2Q12891 473 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TATDN3Q17R31 274 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CARD16Q5EG05 197 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 GPR153Q6NV75 609 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DENND1CQ8IV53 801 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 GPC2Q8N158 579 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PJA1Q8NG27 643 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 RADILQ96JH8 1075 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TNIP3Q96KP6 325 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM209Q96SK2 561 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 APOL4Q9BPW4 351 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 TTPALQ9BTX7 342 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC3Q9BY71 257 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CD274Q9NZQ7 290 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ALG5Q9Y673 324 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 NRCAMQ92823 1304 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A3O75751 556 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A5O76082 557 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 POU1F1P28069 291 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 HTR1EP28566 365 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 CBX5P45973 191 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 DAPP51397 102 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP1Q07960 439 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF79Q15937 498 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 FAM187BQ17R55 369 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRT-211ENST00000618610 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms