RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	CES3	Q6UWW8	571 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578		Q6ZS92	163 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	TCF12	Q99081	682 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-215	ENST00000592578	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578		H3BMM5	538 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	S1PR4	O95977	384 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ARNT	P27540	789 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	OTX2	P32243	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MAGEA6	P43360	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	GABRA4	P48169	554 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	TERF1	P54274	439 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SSPN	Q14714	243 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	NCF4	Q15080	339 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CASC4	Q6P4E1	433 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FOPNL	Q96NB1	174 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MAGEB16	A2A368	324 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578		H3BMH7	237 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FKBP9	O95302	570 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ESR1	P03372	595 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CAPN1	P07384	714 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	STS	P08842	583 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MLN	P12872	115 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MAG	P20916	626 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FMO4	P31512	558 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CCNF	P41002	786 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	GRB7	Q14451	532 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	HCRTR1	O43613	425 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	AVIL	O75366	819 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	C1orf105	O95561	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CHRM3	P20309	590 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CAPN3	P20807	821 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-215	ENST00000592578	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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