RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RNF14Q9UBS8 474 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC151A5D8V7 595 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 KRT87PA6NCN2 255 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF839A8K0R7 811 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC188H7C350 402 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 J3QKU1 62 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TTI1O43156 1089 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 HCRTR1O43613 425 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB14O43829 449 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MATN4O95460 622 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RECKO95980 971 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RAB40ALP0C0E4 278 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CBSLP0DN79 551 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G2AP14555 144 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5DP30049 168 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CMPK1P30085 196 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CASQ1P31415 396 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RORAP35398 523 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CBSP35520 551 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CCL11P51671 97 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CLCN7P51798 805 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DCDP81605 110 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FOXK1P85037 733 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MPP1Q00013 466 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CUL1Q13616 776 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CRYMQ14894 314 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MORF4L2Q15014 288 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 UGT8Q16880 541 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MSS51Q4VC12 460 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SUSD1Q6UWL2 747 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ATG14Q6ZNE5 492 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PALM2Q8IXS6 379 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ9Q92806 393 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5DQ92835 1189 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO2A1Q92959 643 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZUFSPQ96AP4 578 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD17AQ96GS6 310 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 KRT12Q99456 494 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 NDNQ99608 321 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 GPR21Q99679 349 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A3Q99726 388 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf62Q9BQA9 187 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRM-214ENST00000583153 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRM-214ENST00000583153 NLNQ9BYT8 704 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ACSS2Q9NR19 701 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 STARD5Q9NSY2 213 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 EURLQ9NYK6 297 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA7Q9P0W8 599 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TUBD1Q9UJT1 453 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TCFL5Q9UL49 500 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SRPK3Q9UPE1 567 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS7Q9Y394 339 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SPTBP11277 2137 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YVX5 310 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRM-214ENST00000583153 ERICH4A6NGS2 130 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ARGFXA6NJG6 315 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TARM1B6A8C7 271 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SMAPO00193 183 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL1O75677 317 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP9O95302 570 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CTSBP07858 339 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MPC1LP0DKB6 136 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MCM3P25205 808 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PSMB5P28074 263 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 OTX2P32243 289 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B2P37059 387 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ELK3P41970 407 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 GABRA4P48169 554 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RGS4P49798 205 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA8P53708 1063 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PNLIPRP1P54315 467 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ARSFP54793 590 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ARL4CP56559 192 aa7.99□□□□□ -1.13
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