RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLCNKAP51800 687 aa28.21■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYT13Q7L8C5 426 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D21Q8IYX1 336 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 PGBD3Q8N328 593 aa28.21■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PHC3Q8NDX5 983 aa28.21■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GPSM3Q9Y4H4 160 aa28.2■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 POM121BA6NF01 834 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ERGP11308 486 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FLCNQ8NFG4 579 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEIL2Q969S2 332 aa28.19■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EHD1Q9H4M9 534 aa28.19■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 APBB3O95704 486 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AKT2P31751 481 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPP6P42658 865 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0040Q15053 153 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADA2Q9NZK5 511 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf142B7Z368 130 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9JVG2 144 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOR1BO14657 336 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL9P15248 144 aa28.16■■■□□ 2.1
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