RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT12Q99456 494 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC30A3Q99726 388 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDC1Q9BTX1 674 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCFL5Q9UL49 500 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX7Q9UNH6 387 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.43■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM187AA6NFU0 413 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GFYI3L273 518 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCGO15287 622 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HCRTR1O43613 425 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB14O43829 449 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 BANF1O75531 89 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPN1P07384 714 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FURINP09958 794 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMPK1P30085 196 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELK3P41970 407 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIA3P42263 894 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS4P49798 205 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCRL6Q6DN72 434 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUFY1Q96T51 708 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC16AO15027 2179 aa16.42■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PPV9 198 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFPL1O75677 317 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCNDBP1O95273 360 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASQ1P31415 396 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCGRP47871 477 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNLIPRP1P54315 467 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CUL1Q13616 776 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRM7Q14831 915 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCN10Q6JVE6 187 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GBP5Q96PP8 586 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIPEPQ99797 713 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLMPQ9H6B4 373 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.41■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2A25A4D2G3 310 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FITM1A5D6W6 292 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 E7ESA3 106 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A8O95907 504 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 AHSGP02765 367 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8GP07360 202 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMB5P28074 263 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP140Q13342 867 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL10RAQ13651 578 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP36Q96G28 342 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 IP6K3Q96PC2 410 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKP4Q99569 1192 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.4■□□□□ 0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GX78 115 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT87PA6NCN2 255 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TP73O15350 636 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC16A5O15375 505 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCM3P25205 808 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABRB3P28472 473 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABATP80404 500 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNC4Q03721 635 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RELAQ04206 551 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALCOCO2Q13137 446 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.39■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms