RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	GPR89B	P0CG08	455 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HIST1H2AD	P20671	130 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CALB2	P22676	271 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PDHA2	P29803	388 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	BDKRB1	P46663	353 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PIK3CG	P48736	1102 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TPMT	P51580	245 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCNG1	P51959	295 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA1024L	P59773	190 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ABR	Q12979	859 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TRAF3	Q13114	568 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC14A1	Q13336	389 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NXN	Q6DKJ4	435 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ASRGL1	Q7L266	308 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FOXJ1	Q92949	421 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FBXL8	Q96CD0	374 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NSL1	Q96IY1	281 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FOPNL	Q96NB1	174 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRORY	Q9H606	182 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CLMP	Q9H6B4	373 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SGK2	Q9HBY8	427 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FZD3	Q9NPG1	666 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KLC4	Q9NSK0	619 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR1A2	Q9Y585	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LRP4	O75096	1905 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	COL12A1	Q99715	3063 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KRT87P	A6NCN2	255 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CFAP73	A6NFT4	308 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KMO	O15229	486 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC22A2	O15244	555 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC31A1	O15431	190 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	VPS4B	O75351	444 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KATNA1	O75449	491 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR4F21	O95013	312 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C1orf105	O95561	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CHEK2	O96017	543 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EPB42	P16452	691 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ITPKB	P27987	946 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACADL	P28330	430 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PRDX6	P30041	224 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACSL1	P33121	698 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GDF5	P43026	501 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RASSF2	P50749	326 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CFHR1	Q03591	330 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KLF10	Q13118	480 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RPA4	Q13156	261 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NFE2L1	Q14494	772 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NAA25	Q14CX7	972 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	XKR7	Q5GH72	579 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM198	Q66K66	360 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CHSY3	Q70JA7	882 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GLRX5	Q86SX6	157 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	AMZ2	Q86W34	360 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SNX31	Q8N9S9	440 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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