RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 DENND6AQ8IWF6 608 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 OTUD6BQ8N6M0 293 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-231ENST00000552222 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
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CS-231ENST00000552222 SLC40A1Q9NP59 571 aa13.34□□□□□ -0.27
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CS-231ENST00000552222 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 NDUFS3O75489 264 aa13.33□□□□□ -0.28
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CS-231ENST00000552222 SLC1A2P43004 574 aa13.33□□□□□ -0.28
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CS-231ENST00000552222 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GPX6P59796 221 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CTBP1Q13363 440 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CDSNQ15517 529 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 INSCQ1MX18 579 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 Q6ZS92 163 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CYS1Q717R9 158 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 PALM2Q8IXS6 379 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 LPGAT1Q92604 370 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 P2RY12Q9H244 342 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 PRSS21Q9Y6M0 314 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 PCNX1Q96RV3 2341 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 KLHL33A6NCF5 533 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MGAT4DA6NG13 374 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MEN1O00255 615 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 QSOX1O00391 747 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.5
CS-231ENST00000552222 DMPKQ09013 629 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MGAT5Q09328 741 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.32□□□□□ -0.28
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CS-231ENST00000552222 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MED25Q71SY5 747 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 AMZ2Q86W34 360 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 LRRC6Q86X45 466 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 DSELQ8IZU8 1212 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 OR2L2Q8NH16 312 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 UBXN4Q92575 508 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 BIRC8Q96P09 236 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 UCK1Q9HA47 277 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 SPTBP11277 2137 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 SVILO95425 2214 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 OR5K4A6NMS3 321 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 C1QAP02745 245 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GSTM1P09488 218 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 FAM153BP0C7A2 387 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 OR56A5P0C7T3 313 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MYBL2P10244 700 aa13.31□□□□□ -0.28
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CS-231ENST00000552222 ITGA3P26006 1051 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 HTR1EP28566 365 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 RORAP35398 523 aa13.31□□□□□ -0.28
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CS-231ENST00000552222 MPP1Q00013 466 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GSTM4Q03013 218 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 FAM153CQ494X1 144 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GALNT7Q86SF2 657 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 MRGPREQ86SM8 312 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 GALNT16Q8N428 558 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 HM13Q8TCT9 377 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-231ENST00000552222 NLNQ9BYT8 704 aa13.31□□□□□ -0.28
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