RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SNX7Q9UNH6 387 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MUC3AQ02505 3323 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PIPSLA2A3N6 862 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WDR91A4D1P6 747 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OR5K3A6NET4 321 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 E2F3O00716 465 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SNPHO15079 494 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TAPBPO15533 448 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SIGLEC6O43699 453 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 DUX1O43812 170 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 UBXN7O94888 489 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CHEK2O96017 543 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EBLN1P0CF75 366 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GIMD1P0DJR0 217 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NPPBP16860 134 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CKMT2P17540 419 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GRK3P35626 688 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GMPRP36959 345 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HNF4AP41235 474 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CASP2P42575 452 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC1A6P48664 564 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HSPA7P48741 367 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCNG1P51959 295 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LIMK1P53667 647 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TBPL1P62380 186 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 DAB2P98082 770 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 C17orf64Q86WR6 236 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC35F3Q8IY50 421 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EID2Q8N6I1 236 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SNX31Q8N9S9 440 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KYQ8NBH2 561 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MED8Q96G25 268 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 C7orf26Q96N11 449 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TMEM237Q96Q45 408 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ZNF382Q96SR6 550 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MENTQ9BUN1 341 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EDEM2Q9BV94 578 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 IPPKQ9H8X2 491 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PELI2Q9HAT8 420 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 IL21RQ9HBE5 538 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PCTPQ9UKL6 214 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ICKQ9UPZ9 632 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ISM1B1AKI9 464 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TRIM38O00635 465 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PPM1DO15297 605 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CRCPO75575 148 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CLDN9O95484 217 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ESRRBO95718 433 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PROS1P07225 676 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FGF4P08620 206 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PCSK2P16519 638 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 BGNP21810 368 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CAPZBP47756 277 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCR8P51685 355 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MAZP56270 477 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PHEXP78562 749 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 E2F1Q01094 437 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GUCY1A3Q02108 690 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 BST1Q10588 318 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TCEA2Q15560 299 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RBBP7Q16576 425 aa9□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PROX2Q3B8N5 592 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms