RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A0U1RQJ8 604 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 HYKKA2RU49 373 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT87PA6NCN2 255 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ENO4A6NNW6 628 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRTM2O43300 516 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NDUFS3O75489 264 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SLCO2B1O94956 709 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PSMB5P28074 263 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ACVR1Q04771 509 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TLR1Q15399 786 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNMB4Q86W47 210 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MIEF2Q96C03 454 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 HES6Q96HZ4 224 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FOPNLQ96NB1 174 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NFS1Q9Y697 457 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TARM1B6A8C7 271 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 KPNA5O15131 536 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CTSVO60911 334 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 C1orf105O95561 183 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ACPPP15309 386 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GCGRP47871 477 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CARSP49589 748 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ARG2P78540 354 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CRADDP78560 199 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 KLC1Q07866 573 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PCID2Q5JVF3 399 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR11G2Q8NGC1 345 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 COG1Q8WTW3 980 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM136AQ96C01 138 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 C8orf44Q96CB5 159 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CABS1Q96KC9 395 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ACAT2Q9BWD1 397 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PAK5Q9P286 719 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 C3orf18Q9UK00 162 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NOTCH2Q04721 2471 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FITM1A5D6W6 292 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MAP2K7O14733 419 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NRP2O60462 931 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ONECUT2O95948 504 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 EDN3P14138 238 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 CCNFP41002 786 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PER3P56645 1201 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 VWA2Q5GFL6 755 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2L3Q8NG85 312 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 FAR1Q8WVX9 515 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PEX13Q92968 403 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 P2RY12Q9H244 342 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 MED13Q9UHV7 2174 aa11.59□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 DYTNA2CJ06 578 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 VSTM2BA6NLU5 285 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 FFAR3O14843 346 aa11.58□□□□□ -0.56
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR42O15529 346 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms