RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 INCA1Q0VD86 236 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 GPR17Q13304 367 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CCL14Q16627 93 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 AMZ1Q400G9 498 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CDH24Q86UP0 819 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 OSTF1Q92882 214 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL18Q96ME1 805 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PPM1 405 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 B4DGG1 531 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD11O00231 422 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CBFA2T3O75081 653 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CLUP10909 449 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 DDI2Q5TDH0 399 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TFAP2BQ92481 460 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MFSD3Q96ES6 412 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SCLYQ96I15 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PRB8 838 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 C2orf74A8MZ97 194 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF879B4DU55 563 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 BTN3A3O00478 584 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CXCR6O00574 342 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 VNN1O95497 513 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ANGPTL1O95841 491 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 C9P02748 559 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CYP17A1P05093 508 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP8P85298 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FRG2Q64ET8 278 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TOP1MTQ969P6 601 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FRG2BQ96QU4 278 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ASPNQ9BXN1 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 HCN1O60741 890 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 LIPJQ5W064 366 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PHF12Q96QT6 1004 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 EBPLQ9BY08 206 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 DERL2Q9GZP9 239 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ABCG8Q9H221 673 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MEMO1Q9Y316 297 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TIMM22Q9Y584 194 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SLC16A5O15375 505 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PLOD3O60568 738 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 RCBTB2O95199 551 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CYP4B1P13584 511 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 NRIP1P48552 1158 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CASP9P55211 416 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TEAD2Q15562 447 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 UPP1Q16831 310 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 POC5Q8NA72 575 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF570Q96NI8 536 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 CD320Q9NPF0 282 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 MATN2O00339 956 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SASH3O75995 380 aa6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PDE4D-226ENST00000546160 SMSP52788 366 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms