RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUSK	O15146	869 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RFPL2	O75678	378 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	BCKDHA	P12694	445 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RRM2	P31350	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TGFBR1	P36897	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDC42	P60953	191 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAGEH1	Q9H213	219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRRG1	O14668	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZW10	O43264	779 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CPNE6	O95741	557 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	EPO	P01588	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRBC1	P01850	177 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DNTT	P04053	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	FPR1	P21462	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACOX1	Q15067	660 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CSF3R	Q99062	836 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACSL4	O60488	711 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	OXA1L	Q15070	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SIX5	Q8N196	739 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MANBA	O00462	879 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NDUFB5	O43674	189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCL5	P13501	91 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD40LG	P29965	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q96MT0	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705		A6NL46	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TBL1X	O60907	577 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GADD45A	P24522	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MLLT10	P55197	1068 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	MVK	Q03426	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHKG1	Q16816	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705		A0A096LPI6	279 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705		H7C4K7	107 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TSPAN17-208	ENST00000514705	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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