RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MGAT5Q09328 741 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP4K2Q12851 820 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MTAPQ13126 283 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NCOA4Q13772 614 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LPAL2Q16609 132 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 UFD1Q92890 307 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP2A3Q93084 1043 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM74Q96NL1 305 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ACCSQ96QU6 501 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PPA2Q9H2U2 334 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.46□□□□□ -1.69
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RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SARDHQ9UL12 918 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM92AA1XBS5 289 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 I3L4J1 428 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SOCS6O14544 535 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CYB561D2O14569 222 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGESO14684 152 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX11BO96011 259 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ERBB2P04626 1255 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 LIPFP07098 398 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CD1EP15812 388 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MSH3P20585 1137 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR4P46093 362 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LHX1P48742 406 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SCAND1P57086 179 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 22.3
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RABGGTB-213ENST00000496055 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT84Q9NSB2 600 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 EXD2Q9NVH0 621 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MPP6Q9NZW5 540 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A1W2PRU2 124 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 CD72P21854 359 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 LAP3P28838 519 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CRABP1P29762 137 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 MAGEA1P43355 309 aa4.46□□□□□ -1.7
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC34A1Q06495 639 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 DLG1Q12959 904 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RPA4Q13156 261 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 RIN1Q13671 783 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 EOGTQ5NDL2 527 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PERM1Q5SV97 790 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP1Q6P2D0 407 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM13CQ8NE31 585 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 UBA3Q8TBC4 463 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 PYDC1Q8WXC3 89 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-213ENST00000496055 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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