RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 AIG1Q9NVV5 245 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GID8Q9NWU2 228 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 KLQ9UEF7 1012 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SARDHQ9UL12 918 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 SATB2Q9UPW6 733 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC4-211ENST00000492996 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 C7orf72A4D263 438 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ASPDHA6ND91 283 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR7A17O14581 309 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KLK8O60259 260 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TFPTP0C1Z6 253 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OCM2P0CE71 109 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 G6PDP11413 515 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A4P14672 509 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LHCGRP22888 699 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SPAM1P38567 509 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RUNX3Q13761 415 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TBCELQ5QJ74 424 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB2Q8N680 514 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ROPN1LQ96C74 230 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BTBD9Q96Q07 612 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BBS2Q9BXC9 721 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CEP290O15078 2479 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GTW7 788 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PP18 115 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TAPBPO15533 448 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RECKO95980 971 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 C8BP07358 591 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PSMA3P25788 255 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ACRV1P26436 265 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GSK3BP49841 420 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ERVK-8P63133 956 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NTHL1P78549 312 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PTGR1Q14914 329 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 XKR7Q5GH72 579 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NXPE1Q8N323 547 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 OR2T3Q8NH03 318 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 FIBINQ8TAL6 211 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SCAMP4Q969E2 229 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PYCR2Q96C36 320 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ULK4Q96C45 1275 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ZNF382Q96SR6 550 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SEPHS2Q99611 448 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ARPC2O15144 300 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 VPS4BO75351 444 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MATN4O95460 622 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ASGR2P07307 311 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 DGKAP23743 735 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A1P30825 629 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 AKT1P31749 480 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 MTPNP58546 118 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 LIPEQ05469 1076 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 ATP1A4Q13733 1029 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 RCAN2Q14206 197 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC4-211ENST00000492996 TEAD2Q15562 447 aa6.83□□□□□ -1.32
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