RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492170.1

MRPL55-231, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 5

Gene MRPL55, Length 241 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-231	ENST00000492170	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	C4orf22	Q6V702	233 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170		Q6ZS92	163 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	COX15	Q7KZN9	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SPSB2	Q99619	263 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	P2RY12	Q9H244	342 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TREX1	Q9NSU2	369 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	BFAR	Q9NZS9	450 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PCM1	Q15154	2024 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NOTCH2	Q04721	2471 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	FITM1	A5D6W6	292 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	USP27X	A6NNY8	438 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SOCS6	O14544	535 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CBX6	O95503	412 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	C1orf105	O95561	183 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CCNF	P41002	786 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	GLRB	P48167	497 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CRADD	P78560	199 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NAA25	Q14CX7	972 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RBBP7	Q16576	425 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CCNG2	Q16589	344 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CUZD1	Q86UP6	607 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	COG1	Q8WTW3	980 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	INPP5D	Q92835	1189 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	AGAP4	Q96P64	663 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	MIPEP	Q99797	713 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CTSF	Q9UBX1	484 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NFS1	Q9Y697	457 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PFDN6	O15212	129 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CTSV	O60911	334 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ALOX12B	O75342	701 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PSMB5	P28074	263 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NMBR	P28336	390 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	OR1D4	P47884	311 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	NPY2R	P49146	381 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CNST	Q6PJW8	725 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC35F6	Q8N357	371 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	OR2L3	Q8NG85	312 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	C5orf34	Q96MH7	638 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	HYKK	A2RU49	373 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170		H3BMM5	538 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	KIF5C	O60282	957 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	LDLR	P01130	860 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	FGG	P02679	453 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	ERVK-10	P10266	1014 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	OCA2	Q04671	838 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	HIF1A	Q16665	826 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MRPL55-231	ENST00000492170	RNF44	Q7L0R7	432 aa		14.66	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms