RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SBSN	Q6UWP8	590 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ESX1	Q8N693	406 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	OR2L3	Q8NG85	312 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PMEPA1	Q969W9	287 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL8	Q96CD0	374 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	LRFN5	Q96NI6	719 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	APMAP	Q9HDC9	416 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FETUB	Q9UGM5	382 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	HBQ1	P09105	142 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	MAG	P20916	626 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SAT1	P21673	171 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	GRIA3	P42263	894 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	GABRA4	P48169	554 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	HNMT	P50135	292 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CSRP3	P50461	194 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ITGA1	P56199	1179 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD18	Q0P651	414 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KCNAB1	Q14722	419 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM73	Q86UV7	250 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ARL15	Q9NXU5	204 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	OARD1	Q9Y530	152 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087X1B8	175 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	AGRP	O00253	132 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	RIPK2	O43353	540 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KRT38	O76015	456 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC166	P0CW27	439 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PVR	P15151	417 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TLE3	Q04726	772 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	GPR19	Q15760	415 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ZIC1	Q15915	447 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PHKG1	Q16816	387 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ICE2	Q659A1	982 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	GPR135	Q8IZ08	494 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	OR56A3	Q8NH54	315 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	NKD1	Q969G9	470 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ISL2	Q96A47	359 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PAFAH2	Q99487	392 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	MIPEP	Q99797	713 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	CTRC	Q99895	268 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	HAUS8	Q9BT25	410 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SGPP1	Q9BX95	441 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	PPCS	Q9HAB8	311 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SNX7	Q9UNH6	387 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	OR2A25	A4D2G3	310 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KRT87P	A6NCN2	255 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241		E7EQ34	232 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241		H3BMH7	237 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KLK10	O43240	276 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	RAD1	O60671	282 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SCRG1	O75711	98 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	FAM155B	O75949	473 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA0754	O94854	1291 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA5	P08758	320 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB8	P50452	374 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS3	P57727	454 aa		14.06	□□□□□ -0.16

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