RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOXF2Q9BQY4 288 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PRORYQ9H606 182 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 GPAMQ9HCL2 828 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKMY1Q9P2S6 941 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NFU1Q9UMS0 254 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BMH7 237 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 EFSO43281 561 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SCRG1O75711 98 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNDBP1O95273 360 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TIAF1O95411 115 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 STMN1P16949 149 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGA1P56199 1179 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ABATP80404 500 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 VAC14Q08AM6 782 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PHKG1Q16816 387 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FCRL6Q6DN72 434 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRN4CLQ8ND94 238 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 MIPEPQ99797 713 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 DERL2Q9GZP9 239 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PADI1Q9ULC6 663 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SDK2Q58EX2 2172 aa16.21■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ESPNB1AK53 854 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 E7EQ34 232 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 K7ENP7 123 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM155BO75949 473 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HBQ1P09105 142 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CCND1P24385 295 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMB5P28074 263 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RAB10P61026 200 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 RELAQ04206 551 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF460Q14592 562 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SBSNQ6UWP8 590 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR135Q8IZ08 494 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ATL1Q8WXF7 558 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM117AQ9C073 453 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL15Q9NXU5 204 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 EURLQ9NYK6 297 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS20P59510 1910 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2A25A4D2G3 310 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HCRTR1O43613 425 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2B3O76000 313 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSL3O95573 720 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 NTRK1P04629 796 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 HRH2P25021 359 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CRABP2P29373 138 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC26A3P40879 764 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 STAT5AP42229 794 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6V0D1P61421 351 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CDKL1Q00532 357 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.187e-7■■■□□ 18.3
RABGEF1-204ENST00000442563 ICE2Q659A1 982 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 FBXL8Q96CD0 374 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 DPH7Q9BTV6 452 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 LHX9Q9NQ69 397 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 TAC3Q9UHF0 121 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 SNX7Q9UNH6 387 aa16.19■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms