RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMEM209Q96SK2 561 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OR10A4Q9H209 315 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 BRD7Q9NPI1 651 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DISC1C4P0D8 188 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TNFP01375 233 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FESP07332 822 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SELPP16109 830 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CAP1Q01518 475 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MERTKQ12866 999 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SYT16Q17RD7 645 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LPCAT4Q643R3 524 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARSKQ6UWY0 536 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SHDQ96IW2 340 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MYOCQ99972 504 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 USP29Q9HBJ7 922 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TREM1Q9NP99 234 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FNIP2Q9P278 1114 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CDH1P12830 882 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CD72P21854 359 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RGS19P49795 217 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PGDP52209 483 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CAPZA1P52907 286 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CD47Q08722 323 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C12orf40Q86WS4 652 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HID1Q8IV36 788 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FTMTQ8N4E7 242 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C17orf50Q8WW18 174 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TAMM41Q96BW9 452 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ABCG8Q9H221 673 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLK2Q9NYY3 685 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MROH2AA6NES4 1674 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NPIPA5E9PKD4 350 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 M0QX08 132 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CD36P16671 472 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CDKN2BP42772 138 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TAS2R40P59535 323 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FAM129CQ86XR2 697 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAFFQ9ULX9 164 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TIMM22Q9Y584 194 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TECPR2O15040 1411 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PSMD9O00233 223 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARPC2O15144 300 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MMP3P08254 477 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SLC5A3P53794 718 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FOXM1Q08050 763 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ST3GAL3Q11203 375 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 VITQ6UXI7 678 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 HES2Q9Y543 173 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 AGLP35573 1532 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PRB8 838 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PCDH7O60245 1069 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAGP20916 626 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ICAM3P32942 547 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 CCL23P55773 120 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 TPTEP56180 551 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLGLB1Q02325 96 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.53□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 RAB12Q6IQ22 244 aa6.53□□□□□ -1.36
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