RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNH6Q9H252 994 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OLAHQ9NV23 265 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.17■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E7EQ34 232 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H6PDO95479 791 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOD1P00441 154 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCSK2P16519 638 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NELFEP18615 380 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BDKRB1P46663 353 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MERTKQ12866 999 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM47BQ8NA70 645 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGLN2Q96KS0 407 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HHIPQ96QV1 700 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BDH2Q9BUT1 245 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIP2Q9C0E4 1043 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF639Q9UID6 485 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INVSQ9Y283 1065 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP3M1Q9Y2T2 418 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A096LPI6 279 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOVL7A1L3X0 281 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTA4O15217 222 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6B1O95007 311 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNAO1P09471 354 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAP2AP10114 183 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB7P26010 798 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF33BQ06732 778 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAE1Q13564 534 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAB4Q2WGN9 574 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NADK2Q4G0N4 442 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf64Q5T6V5 341 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP8Q86W28 1048 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARRDC3Q96B67 414 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED8Q96G25 268 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITCHQ96J02 903 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS50Q96JG6 964 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCRL1Q96LA6 429 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RMND5AQ9H871 391 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GULP1Q9UBP9 304 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa18.16■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BNH8 94 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPC1O15118 1278 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLOCKO15516 846 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRATO95237 230 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFATC1O95644 943 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A8O95907 504 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IMPA1P29218 277 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPN6P29350 595 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDHA2P29803 388 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK9P45984 424 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOC2AQ14183 400 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGS1Q32NB8 556 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG9BQ674R7 924 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD46Q86W74 232 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHACTR4Q8IZ21 702 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMIEQ8NEW7 156 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8D1Q8WZ84 308 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4K3Q96R72 315 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP5KQ9BT40 448 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HPS4Q9NQG7 708 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEC1Q9P2X7 70 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.15■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GALT4O96024 378 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF23P17027 643 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYF6P23409 242 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNB3Q05901 458 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP7Q14244 749 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC36A3Q495N2 470 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM74Q86UV6 250 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms