RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KCNK6Q9Y257 313 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 THADAQ6YHU6 1953 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 H0Y8X5 98 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MANBAO00462 879 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PIP5K1BO14986 540 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00032P0C843 101 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRR35P0CG20 571 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MAPK1P28482 360 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PTPN4P29074 926 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ACTR1BP42025 376 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BDKRB1P46663 353 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ACTR1AP61163 376 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 19.2
HDLBP-211ENST00000425989 RELAQ04206 551 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GRB7Q14451 532 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CLCA4Q14CN2 919 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 IMPG1Q17R60 797 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FRG2Q64ET8 278 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MED27Q6P2C8 311 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf64Q86WR6 236 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TTLQ8NG68 377 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SNX19Q92543 992 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FRG2BQ96QU4 278 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 UCK1Q9HA47 277 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 EFCAB1Q9HAE3 211 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ACSS2Q9NR19 701 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ASIC5Q9NY37 505 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SNX7Q9UNH6 387 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ASB1Q9Y576 335 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM22Q9Y584 194 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 COL6A3P12111 3177 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GTW7 788 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 A6NCN8 305 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM221A6NGB7 291 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 E9PBE3 544 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 M0R296 226 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL41O60662 606 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NPPAP01160 153 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 VIPP01282 170 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 T-ENOLP0DO92 83 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRPS2P11908 318 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 JUNDP17535 347 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 EPORP19235 508 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ITPKAP23677 461 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
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