RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 TNNQ9UQP3 1299 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CSAG2Q9Y5P2 127 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SOCS3O14543 225 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ENTPD3O75355 529 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GJB3O75712 270 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 DDHD2O94830 711 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SEC24AO95486 1093 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ACADSP16219 412 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GCNT1Q02742 428 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 RAPSNQ13702 412 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 G2E3Q7L622 706 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 OR10S1Q8NGN2 331 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 OR1L3Q8NH93 324 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 THAP2Q9H0W7 228 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 THEGQ9P2T0 379 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.56□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MPTX1A8MV57 137 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 JAK1P23458 1154 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 DNASE1P24855 282 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PTPN3P26045 913 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 RAD52P43351 418 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PSMC6P62333 389 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CBWD6Q4V339 395 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SLC35D3Q5M8T2 416 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MAPK15Q8TD08 544 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CENPTQ96BT3 561 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SPDL1Q96EA4 605 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SFXN2Q96NB2 322 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GDE1Q9NZC3 331 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GPR34Q9UPC5 381 aa4.55□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 EPM2AB3EWF7 344 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 IGHV2-70P01814 119 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MS4A2Q01362 244 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CUL4AQ13619 759 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MEA1Q16626 185 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 APPL2Q8NEU8 664 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 OR6S1Q8NH40 331 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 JAKMIP2Q96AA8 810 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ARSGQ96EG1 525 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.54□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 AGRNO00468 2067 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PRKACGP22612 351 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 KRT20P35900 424 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CCR10P46092 362 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CALCOCO2Q13137 446 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SNAPC1Q16533 368 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 UGT3A1Q6NUS8 523 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FAM198BQ6UWH4 519 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 THAP8Q8NA92 274 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NUP37Q8NFH4 326 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 TMCO6Q96DC7 493 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FAM20AQ96MK3 541 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SERINC2Q96SA4 455 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.53□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ERCC6Q03468 1493 aa4.52□□□□□ -1.69
TRPS1-204ENST00000422939 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.52□□□□□ -1.69
TRPS1-204ENST00000422939 A0A1W2PR80 420 aa4.52□□□□□ -1.69
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