RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CR2P20023 1033 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GTF2H3Q13889 308 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CHRNA6Q15825 494 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GALNT10Q86SR1 603 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 STK40Q8N2I9 435 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LIX1Q8N485 282 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EID2BQ96D98 161 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DHRS7Q9Y394 339 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ARVCFO00192 962 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MTX2O75431 263 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 NPTX1Q15818 432 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RETSATQ6NUM9 610 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 FAR1Q8WVX9 515 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 OR52E6Q96RD3 313 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PSD2Q9BQI7 771 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DSN1Q9H410 356 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PARVBQ9HBI1 364 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ANGPTL1O95841 491 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MT-ND2P03891 347 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 INHAP05111 366 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CHRNB1P11230 501 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PFKLP17858 780 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CYP4F8P98187 520 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GTDC1Q4AE62 458 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 VAPAQ9P0L0 249 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PCM1Q15154 2024 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MEN1O00255 615 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 UPK1AO00322 258 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RGS14O43566 566 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ANXA6P08133 673 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EPB42P16452 691 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 DGKAP23743 735 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HOXD10P28358 340 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CA5AP35218 305 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LYPD8Q6UX82 237 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MUL1Q969V5 352 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF382Q96SR6 550 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 MBOAT4Q96T53 435 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RMND5AQ9H871 391 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 COMMD8Q9NX08 183 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SNX6Q9UNH7 406 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM64BA6NI03 449 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 NUAK1O60285 661 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 PRSS23O95084 383 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CXCR2P25025 360 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 EPHA2P29317 976 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 CASP3P42574 277 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RBFAQ8N0V3 343 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 RUBCNLQ9H714 662 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 SRRDQ9UH36 339 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 YIPF1Q9Y548 306 aa14.65□□□□□ -0.06
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF682O95780 498 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 WEE1P30291 646 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CLCN7P51798 805 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 CRY1Q16526 586 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 AHSA2Q719I0 299 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 PLD4Q96BZ4 506 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-206ENST00000405546 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms