RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQ72 361 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 IDSB3KWA1 339 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FAM227AF5H4B4 570 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FFAR3O14843 346 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GPR42O15529 346 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 KDM1AO60341 852 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CD9P21926 228 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CXCR2P25025 360 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 RBL1P28749 1068 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 GRB7Q14451 532 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 DENND5AQ6IQ26 1287 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 STMN3Q9NZ72 180 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.35■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SMTNL1A8MU46 457 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 FANCGO15287 622 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM253P0C7T8 217 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PCOLCEQ15113 449 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF766Q5HY98 468 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 RIC8BQ9NVN3 520 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa18.34■□□□□ 0.53
HOXD12-201ENST00000404162 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 H7C0S8 307 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NRP2O60462 931 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 S1PR4O95977 384 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINC1P01008 464 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FTH1P02794 183 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 MYBL2P10244 700 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 FBLP22087 321 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PSMB4P28070 264 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF33BQ06732 778 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SPARCL1Q14515 664 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SYTL3Q4VX76 610 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 OR4N4Q8N0Y3 316 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 IMPACTQ9P2X3 320 aa18.33■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0J9YVX5 310 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HACD1B0YJ81 288 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ST13P50502 369 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SLC18A3Q16572 532 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 LONRF1Q17RB8 773 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 C3P1Q6ZMU1 363 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 VRK3Q8IV63 474 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP11Q8TF27 550 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZUFSPQ96AP4 578 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SDCCAG3Q96C92 435 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf90Q96M02 699 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HES7Q9BYE0 225 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TARM1B6A8C7 271 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 HEXBP07686 556 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 EFNA3P52797 238 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP61Q8NHU2 1237 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 NRGNQ92686 78 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 IMMP1LQ96LU5 166 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 DMRTA2Q96SC8 542 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL1Q9NR64 748 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 GTF3C1Q12789 2109 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.3■□□□□ 0.52
HOXD12-201ENST00000404162 OR51F1A6NGY5 319 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms