RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 TEX101Q9BY14 249 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 OCEL1Q9H607 264 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 USP22Q9UPT9 525 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.52□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 QSOX1O00391 747 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 MAP3K7O43318 606 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CIB2O75838 187 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 IDO1P14902 403 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 HNMTP50135 292 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 AP1S2P56377 157 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FAM3CQ92520 227 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 USP7Q93009 1102 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 EGLN2Q96KS0 407 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PIF1Q9H611 641 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 EBF1Q9UH73 591 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 VEGFDO43915 354 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC22A3O75751 556 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ETHE1O95571 254 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TRIM23P36406 574 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TBPL1P62380 186 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 IRF8Q02556 426 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LSAMPQ13449 338 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CCINQ13939 588 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 IMPG1Q17R60 797 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 C16orf89Q6UX73 402 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LIX1Q8N485 282 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CCDC138Q96M89 665 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GPR34Q9UPC5 381 aa14.51□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ANKRD28O15084 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CEACAM5P06731 702 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GABRG2P18507 467 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ATP4BP51164 291 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CLCNKAP51800 687 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CDC16Q13042 620 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 STX5Q13190 355 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FOPNLQ96NB1 174 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GBP5Q96PP8 586 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 EBPLQ9BY08 206 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CA14Q9ULX7 337 aa14.5□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FXYD1O00168 92 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LRATO95237 230 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 BAG2O95816 211 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 C1QCP02747 245 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 NPPBP16860 134 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 DRD1P21728 446 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PSMB5P28074 263 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ACADVLP49748 655 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TPMTP51580 245 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLC7A2P52569 658 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 KIAA0040Q15053 153 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LIN52Q52LA3 116 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 RABL3Q5HYI8 236 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 HORMAD1Q86X24 394 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FAM110BQ8TC76 370 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 HM13Q8TCT9 377 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TMEM74Q96NL1 305 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 XKR8Q9H6D3 395 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 FGF22Q9HCT0 170 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 VPS4BO75351 444 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 IL9P15248 144 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 TAP2Q03519 686 aa14.49□□□□□ -0.09
MKS1-202ENST00000393119 EMX2Q04743 252 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms