RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZMYND15Q9H091 742 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RHOJQ9H4E5 214 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FGF21Q9NSA1 209 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 STARD5Q9NSY2 213 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA7Q9P0W8 599 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZFATQ9P243 1243 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NFU1Q9UMS0 254 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CHD6Q8TD26 2715 aa3.34□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.34□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ATRXP46100 2492 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 OR2A25A4D2G3 310 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 STMND1H3BQB6 276 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 H7BY64 318 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 K7ENP7 123 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MEN1O00255 615 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MATN2O00339 956 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NDC80O14777 642 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 HAT1O14929 419 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC16A5O15375 505 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NKX2-8O15522 239 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TAPBPO15533 448 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 P2RX6O15547 441 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RIPK2O43353 540 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF749O43361 778 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ZBTB14O43829 449 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF4O60810 478 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ACSL3O95573 720 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CATP04040 527 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RPN2P04844 631 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 C8GP07360 202 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GSTA2P09210 222 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CD1DP15813 335 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NPPBP16860 134 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CD82P27701 267 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CCNFP41002 786 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 STAT5AP42229 794 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MAGEA12P43365 314 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IL2P60568 153 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TUBB4BP68371 445 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CXADRP78310 365 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NFKB2Q00653 900 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IRF9Q00978 393 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ACY1Q03154 408 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD18Q0P651 414 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NAE1Q13564 534 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 BMPR2Q13873 1038 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MAP7Q14244 749 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LINC00303Q3SY05 128 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MANEAQ5SRI9 462 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GRTP1Q5TC63 336 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ICE2Q659A1 982 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FAM198BQ6UWH4 519 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 COX15Q7KZN9 410 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RNF44Q7L0R7 432 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ISCA2Q86U28 154 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PAQR7Q86WK9 346 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PLD3Q8IV08 490 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CTAGE3PQ8IX95 158 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms