RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB5P28074 263 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 GABRA4P48169 554 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CTBP1Q13363 440 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 NCF4Q15080 339 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 LONRF1Q17RB8 773 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.37□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.36□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ9Q92806 393 aa7.36□□□□□ -1.23
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SGMS1-201ENST00000361543 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 NDC1Q9BTX1 674 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.36□□□□□ -1.23
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM4Q9C037 500 aa7.36□□□□□ -1.23
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