RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334490.5

C9orf47-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf47, Length 4,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-201ENST00000334490 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DUXAA6NLW8 204 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SRCP12931 536 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 HYAL2Q12891 473 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 BROXQ5VW32 411 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 XKRYO14609 159 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SHMT2P34897 504 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FAM149AA5PLN7 773 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NPC1O15118 1278 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 B4GALT2O60909 372 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 KAT2AQ92830 837 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FZD3Q9NPG1 666 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NCDNQ9UBB6 729 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CAPN8A6NHC0 703 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 H7BY64 318 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MANBAO00462 879 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NR2F6P10588 404 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CDH1P12830 882 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ARSAP15289 507 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 HMGCLP35914 325 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CHN2P52757 468 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CRISP3P54108 245 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PDK3Q15120 406 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CXCR6O00574 342 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MED26O95402 600 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 EBLN1P0CF75 366 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 JUNDP17535 347 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MYBPC1Q00872 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RELTQ969Z4 430 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DGAT2Q96PD7 388 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PLK4O00444 970 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CDH12P55289 794 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SLC18A2Q05940 514 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RAPSNQ13702 412 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 GJD3Q8N144 294 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CD244Q9BZW8 370 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NHSQ6T4R5 1651 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 VEGFDO43915 354 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 GBAP04062 536 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ACRV1P26436 265 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRAF3Q13114 568 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 OR52B2Q96RD2 323 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NUAK2Q9H093 628 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DNAJB1P25685 340 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NRG3P56975 720 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SNAPC1Q16533 368 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 S100A14Q9HCY8 104 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 HIDE1A8MVS5 230 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ADAMDEC1O15204 470 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DGKQP52824 942 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms