RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf105O95561 183 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ITGA3P26006 1051 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 COL8A1P27658 744 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GCGRP47871 477 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GLRBP48167 497 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TERF1P54274 439 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF787Q6DD87 383 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CUZD1Q86UP6 607 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FKBP10Q96AY3 582 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 BIRC8Q96P09 236 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FBXL4Q9UKA2 621 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 NFS1Q9Y697 457 aa20.23■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1B0GX78 115 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 PFDN6O15212 129 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FKBP9O95302 570 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ITGAXP20702 1163 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 MMP11P24347 488 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FMO4P31512 558 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 VPS41P49754 854 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ARSFP54793 590 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 LPGAT1Q92604 370 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 NACC2Q96BF6 587 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 C5orf34Q96MH7 638 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FOPNLQ96NB1 174 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 TCF12Q99081 682 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CDC23Q9UJX2 597 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CENPEQ02224 2701 aa20.22■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ITPR2Q14571 2701 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 AVILO75366 819 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GRIA3P42263 894 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 BDKRB1P46663 353 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 GPS1Q13098 491 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 KCNJ11Q14654 390 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ARMC3Q5W041 872 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 FCRL6Q6DN72 434 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.21■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 H3BMM5 538 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ALOX12BO75342 701 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 KRT14P02533 472 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ALBP02768 609 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ESR1P03372 595 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 DCTP40126 519 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 CCNFP41002 786 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEA6P43360 314 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 CNSTQ6PJW8 725 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 FAM136AQ96C01 138 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 WDR54Q9H977 334 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 CUTCQ9NTM9 273 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.2■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 KRT87PA6NCN2 255 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 TARM1B6A8C7 271 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 SOCS6O14544 535 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 DSCR3O14972 297 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 NIPSNAP2O75323 286 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 ONECUT2O95948 504 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 PAMP19021 973 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 GBX1Q14549 363 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 NKG7Q16617 165 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 HIF1AQ16665 826 aa20.19■□□□□ 0.82
SOCS1-201ENST00000332029 TCTE1Q5JU00 501 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms