RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 COPS8Q99627 209 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ELOVL7A1L3X0 281 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GABBR2O75899 941 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CDK14O94921 469 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SCELO95171 688 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SYN1P17600 705 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ALAS2P22557 587 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SEMA3BQ13214 749 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CHSY3Q70JA7 882 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OFCC1Q8IZS5 231 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 FERD3LQ96RJ6 166 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 EVPLQ92817 2033 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OR5F1O95221 314 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RAP2AP10114 183 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NR1D2Q14995 579 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PSMA8Q8TAA3 256 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SRRDQ9UH36 339 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PDLIM1O00151 329 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CCL16O15467 120 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ABRQ12979 859 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 FUT10Q6P4F1 479 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 UGT2A3Q6UWM9 527 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SERINC5Q86VE9 423 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ACVR1CQ8NER5 493 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 STON2Q8WXE9 905 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ESAMQ96AP7 390 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 C12orf66Q96MD2 445 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PAAF1Q9BRP4 392 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NMUR1Q9HB89 426 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NPPAP01160 153 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PPP2R2BQ00005 443 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OAFQ86UD1 273 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MINDY1Q8N5J2 469 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 KREMEN2Q8NCW0 462 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PLD4Q96BZ4 506 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TREX1Q9NSU2 369 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 LTBP1Q14766 1721 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SSC5DA1L4H1 1573 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 IRGMA1A4Y4 181 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NIPSNAP2O75323 286 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CDH1P12830 882 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GRIK2Q13002 908 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PERM1Q5SV97 790 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RASAL3Q86YV0 1011 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OR10H5Q8NGA6 315 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GALPQ9UBC7 116 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 DOCK1Q14185 1865 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ILVBLA1L0T0 632 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CDC7O00311 574 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 STK16O75716 305 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PRKCGP05129 697 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GJA5P36382 358 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 HSPA7P48741 367 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 INHBCP55103 352 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SCRN3Q0VDG4 424 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GALNT18Q6P9A2 607 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SLC13A3Q8WWT9 602 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 C5orf34Q96MH7 638 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NECTIN3Q9NQS3 549 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CKLFQ9UBR5 152 aa12.03□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PRORSD1PA6NEY8 169 aa12.02□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MCIDASD6RGH6 385 aa12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms