RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 ILKQ13418 452 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CYP2A13Q16696 494 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ATG16L1Q676U5 607 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 UBTD2Q8WUN7 234 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 RABEP2Q9H5N1 569 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 WWOXQ9NZC7 414 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 E7ENX8 843 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 GGT5P36269 586 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 HNMTP50135 292 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 RAB28P51157 221 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PNLIPRP1P54315 467 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TAP2Q03519 686 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 LIPMQ5VYY2 423 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PYCR2Q96C36 320 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC3Q9BQI4 270 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TMCO1Q9UM00 188 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 DNAJB13P59910 316 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 HERVK_113P63132 956 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PTCHD3Q3KNS1 767 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CGB2Q6NT52 195 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 OR56A3Q8NH54 315 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 LCN9Q8WX39 176 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 FAM107BQ9H098 131 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SNX3O60493 162 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TRIM13O60858 407 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 GP1BAP07359 652 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 IMPDH1P20839 514 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 GRK2P25098 689 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TBPL1P62380 186 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SHC2P98077 582 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 NAE1Q13564 534 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ARHGAP19Q14CB8 494 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 44.9
FAM53B-201ENST00000280780 CHI3L2Q15782 390 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 UNC50Q53HI1 259 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 HES3Q5TGS1 186 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ANKS6Q68DC2 871 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CCDC126Q96EE4 140 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 C7orf26Q96N11 449 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CD244Q9BZW8 370 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PPV9 198 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 A0A1W2PQM1 296 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 E2F3O00716 465 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 B4GAT1O43505 415 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 SERPINE1P05121 402 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 GLB1P16278 677 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 ARRB2P32121 409 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 CCR10P46092 362 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 NAGLUP54802 743 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 CCL7P80098 99 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 OCRLQ01968 901 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 BST1Q10588 318 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 PLCL1Q15111 1095 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 AVL9Q8NBF6 648 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 ATL1Q8WXF7 558 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM53B-201ENST00000280780 OR4K3Q96R72 315 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms