RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 CRY2Q49AN0 593 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DSELQ8IZU8 1212 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NDNFQ8TB73 568 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ALG6Q9Y672 507 aa6.61□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A1W2PPQ1 181 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L15C9J2P7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L11C9JVI0 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L18D6R9N7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L22D6RA61 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L19D6RCP7 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L20D6RJB6 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PCDH17O14917 1159 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PPP1R2P9O14990 202 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 UBDO15205 165 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC6A4P31645 630 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 BRCC3P46736 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ALDH3B2P48448 385 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CCR4P51679 360 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L24Q0WX57 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CDH17Q12864 832 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MGME1Q9BQP7 344 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GGA3Q9NZ52 723 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 M0R143 59 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OPN1LWP04000 364 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HRGP04196 525 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CAPNS1P04632 268 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PRKCGP05129 697 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 URODP06132 367 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CKMT1AP12532 417 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FOXN2P32314 431 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RAB8AP61006 207 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZBTB6Q15916 424 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MFSD3Q96ES6 412 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PKP2Q99959 881 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CA14Q9ULX7 337 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LALBAP00709 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CHRNA1P02708 482 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FTH1P02794 183 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TSHRP16473 764 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NEK7Q8TDX7 302 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NSMAFQ92636 917 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTP4A1Q93096 173 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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PDGFRA-201ENST00000257290 CPVLQ9H3G5 476 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC22A7Q9Y694 548 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 METTL15A6NJ78 407 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RNF212BA8MTL3 300 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LINC00587B1AMM8 73 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MAGEB2O15479 319 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 REM1O75628 298 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CALCRP30988 508 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SCNN1GP51170 649 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GPR143P51810 404 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CASP9P55211 416 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TNFRSF17Q02223 184 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PRKAA1Q13131 559 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SYTL3Q4VX76 610 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.6□□□□□ -1.35
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