RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 TMEM9Q9P0T7 183 aa15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 POMT2Q9UKY4 750 aa15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 DMXL1Q9Y485 3027 aa15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 C2orf74A8MZ97 194 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 STX16O14662 325 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 TM4SF5O14894 197 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 RFPL3O75679 317 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 GP1BAP07359 652 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 NR1D1P20393 614 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 ALDH3A1P30838 453 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PRKAA2P54646 552 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PPP2R2AP63151 447 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PRKAA1Q13131 559 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 KIR2DS3Q14952 304 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 GLRX5Q86SX6 157 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 MOCOSQ96EN8 888 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 TGM7Q96PF1 710 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OR2A14Q96R47 310 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OR4K3Q96R72 315 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 MIPEPQ99797 713 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PITPNM3Q9BZ71 974 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CD244Q9BZW8 370 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 ABCG4Q9H172 646 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC32A1Q9H598 525 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OPTCQ9UBM4 332 aa15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 WDR91A4D1P6 747 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 GIPC1O14908 333 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 STK16O75716 305 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 BPGMP07738 259 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 LSSP48449 732 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC18A1P54219 525 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 HERVK_113P63132 956 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 HHATQ5VTY9 493 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SPESP1Q6UW49 350 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SNX31Q8N9S9 440 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC6A20Q9NP91 592 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 OXSMQ9NWU1 459 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 KLHL3Q9UH77 587 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PCTPQ9UKL6 214 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 ADAMTS20P59510 1910 aa15.15■□□□□ 0.02
CCL25-201ENST00000253451 PCM1Q15154 2024 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 D6RAR5 112 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 K7EPI3 171 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 MATN2O00339 956 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 E2F3O00716 465 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 ZW10O43264 779 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 PVRP15151 417 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 EPORP19235 508 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 CCND1P24385 295 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 MPSTP25325 297 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 CLDN6P56747 220 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 CDC16Q13042 620 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 PDK4Q16654 411 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 UNC50Q53HI1 259 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 LIPMQ5VYY2 423 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 ICE2Q659A1 982 aa15.14■□□□□ 0.01
CCL25-201ENST00000253451 LCTLQ6UWM7 567 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms