RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 SETDB1Q15047 1291 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PDK4Q16654 411 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2A13Q16696 494 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PFKFB4Q16877 469 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 AGTRAPQ6RW13 159 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 OOSP2Q86WS3 158 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 OR4E2Q8NGC2 313 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RSC1A1Q92681 617 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC126Q96EE4 140 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 IL17FQ96PD4 163 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NRTNQ99748 197 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 OXSMQ9NWU1 459 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 FAM221BA6H8Z2 402 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 STX16O14662 325 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 BPGMP07738 259 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 CSF2RBP32927 897 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SHMT2P34897 504 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 GGT5P36269 586 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PNLIPRP1P54315 467 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SQSTM1Q13501 440 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ANKS6Q68DC2 871 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 RGS9BPQ6ZS82 235 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SLC22A9Q8IVM8 553 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM42Q8IWZ5 723 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 UBTD2Q8WUN7 234 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PHF21BQ96EK2 531 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 XKR8Q9H6D3 395 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 WWOXQ9NZC7 414 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR6C74A6NCV1 312 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF839A8K0R7 811 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 BIRC5O15392 142 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH3A1P30838 453 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SLC6A12P48065 614 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PRKAA2P54646 552 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PRKAA1Q13131 559 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PLXDC1Q8IUK5 500 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC8CQ8TDW0 803 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM74Q96NL1 305 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 MECRQ9BV79 373 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR5K3A6NET4 321 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 E7ENX8 843 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 CSO75390 466 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 AGTR2P50052 363 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SEC24CP53992 1094 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 DNAJB13P59910 316 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TAP2Q03519 686 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 CFHR1Q03591 330 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 IRGCQ6NXR0 463 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SYTL1Q8IYJ3 562 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR56A3Q8NH54 315 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 BCAS4Q8TDM0 211 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TWSG1Q9GZX9 223 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 OR6C2Q9NZP2 312 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 FAM149AA5PLN7 773 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 TCP11X1B4DZS4 312 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 FAM107AO95990 144 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ADRB1P08588 477 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 NEFHP12036 1026 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 HSPA7P48741 367 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 INHBCP55103 352 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 NAE1Q13564 534 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 ISXQ2M1V0 245 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.8■□□□□ 0.6
HOXD11-201ENST00000249504 SNAP47Q5SQN1 464 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms