RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 NMUR1Q9HB89 426 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CYP3A4P08684 503 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PTGER3P43115 390 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 FOXM1Q08050 763 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CARTPTQ16568 116 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LNX2Q8N448 690 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ELP5Q8TE02 316 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LRRC3Q9BY71 257 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CENPMQ9NSP4 180 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 GHRLQ9UBU3 117 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PEX12O00623 359 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MLC1Q15049 377 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 FCAMRQ8WWV6 532 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ISPDA4D126 451 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 RAD51DO75771 328 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PTPRAP18433 802 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 KCNJ5P48544 419 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 GTF2BQ00403 316 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 GRIK2Q13002 908 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LRRC66Q68CR7 880 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 IRGQQ8WZA9 623 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CD180Q99467 661 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CMKLR1Q99788 373 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 FN3KQ9H479 309 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 TLE6Q9H808 572 aa11.6□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MAP2K7O14733 419 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MUSKO15146 869 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 POU2F1P14859 743 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 HSPA7P48741 367 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 RGS6P49758 472 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CTBP2P56545 445 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MFSD5Q6N075 450 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 HERVK_113Q902F9 699 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SHC3Q92529 594 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SEC61A2Q9H9S3 476 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 KCND1Q9NSA2 647 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 KCNQ2O43526 872 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 OAZ2O95190 189 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MALT1Q9UDY8 824 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 A0A1B0GVI7 797 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 GJB6O95452 261 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLC9A3P48764 834 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 C12orf40Q86WS4 652 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 USP32Q8NFA0 1604 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 OR6C6A6NF89 314 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CHMP24386 653 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PLP2Q04941 152 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 GPR21Q99679 349 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 CLTCL1P53675 1640 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ESR1P03372 595 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 IL3P08700 152 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 HTR1AP08908 422 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 SLC5A3P53794 718 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 ADGRE1Q14246 886 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 RAD9AQ99638 391 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 IL33O95760 270 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PLD4Q96BZ4 506 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.59□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 LAG3P18627 525 aa11.58□□□□□ -0.55
GREB1-201ENST00000234142 NRIP1P48552 1158 aa11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms