RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CD200R1Q8TD46 325 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CT55Q8WUE5 264 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 LRFN5Q96NI6 719 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 KRT87PA6NCN2 255 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MEN1O00255 615 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TP73O15350 636 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB14O43829 449 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 OR2B3O76000 313 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MPC1LP0DKB6 136 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 RGS4P49798 205 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 GPS2Q13227 327 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 LY6DQ14210 128 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TBR1Q16650 682 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 STEAP4Q687X5 459 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 GALNT7Q86SF2 657 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 GPR87Q9BY21 358 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 RAB17Q9H0T7 212 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZFATQ9P243 1243 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ATMQ13315 3056 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZNF839A8K0R7 811 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZNF749O43361 778 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MCM3P25205 808 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 GABRB3P28472 473 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 HSD17B2P37059 387 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CYP2A13Q16696 494 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 BORAQ6PGQ7 559 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 E7ESA3 106 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MYO1CO00159 1063 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TERTO14746 1132 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CDC20Q12834 499 aa21.53■■□□□ 1.04
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SYT6-210ENST00000641643 SMPDL3AQ92484 453 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZUFSPQ96AP4 578 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa21.53■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PRB1P04280 392 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ERV3-1Q14264 604 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 LINC00303Q3SY05 128 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 DUPD1Q68J44 220 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PALM2Q8IXS6 379 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 GPATCH11Q8N954 259 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MNS1Q8NEH6 495 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PYROXD1Q8WU10 500 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SEC14L1Q92503 715 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MED8Q96G25 268 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PKP4Q99569 1192 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 MIPEPQ99797 713 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CHST8Q9H2A9 424 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SYT6-210ENST00000641643 TARM1B6A8C7 271 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 HCRTR1O43613 425 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CREG1O75629 220 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 AGXTP21549 392 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PSMB5P28074 263 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RORAP35398 523 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CCR10P46092 362 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 GABRA4P48169 554 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 MGAT5Q09328 741 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 NAA25Q14CX7 972 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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