RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623163.3

SNHG5-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 851 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-215	ENST00000623163	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG5-215	ENST00000623163	TFR2	Q9UP52	801 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SNHG5-215	ENST00000623163	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG5-215	ENST00000623163	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SNHG5-215	ENST00000623163	ZFHX3	Q15911	3703 aa		13.77	□□□□□ -0.2
SNHG5-215	ENST00000623163	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SLCO2B1	O94956	709 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	S1PR4	O95977	384 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	OR56A5	P0C7T3	313 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CCR7	P32248	378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	MFAP5	Q13361	173 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	GRM7	Q14831	915 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	POU6F1	Q14863	301 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ATG9B	Q674R7	924 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163		A0A1B0GUH1	482 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	PSMD3	O43242	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	OR1I1	O60431	355 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ALAS2	P22557	587 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	RWDD2B	P57060	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	P3H1	Q32P28	736 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	PSMF1	Q92530	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	PEX13	Q92968	403 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CARD6	Q9BX69	1037 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	OR51F1	A6NGY5	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163		F8W8V4	182 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	PCDH17	O14917	1159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ZG16	O60844	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CTSV	O60911	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ALOX12B	O75342	701 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	KLHL18	O94889	574 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	HP	P00738	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SOX11	P35716	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CDC16	Q13042	620 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	BRD3	Q15059	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	MTOR	P42345	2549 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	C2orf72	A6NCS6	295 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	SUN1	O94901	812 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	MED26	O95402	600 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	RPN2	P04844	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	MCM3	P25205	808 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	AOAH	P28039	575 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	GRIA3	P42263	894 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	EMP3	P54852	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	GDF10	P55107	478 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	ART3	Q13508	389 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SNHG5-215	ENST00000623163	INA	Q16352	499 aa		13.74	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms