RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD52Q8NB46 1076 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM185BQ9H7F4 350 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ERBB2P04626 1255 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 RGS6P49758 472 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GNA12Q03113 381 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 QPCTQ16769 361 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A16Q86VW1 577 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 C5orf60A6NFR6 353 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP3A4P08684 503 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ALPPL2P10696 532 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 AQP4P55087 323 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 BORCS7Q96B45 105 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MATKP42679 507 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 LHFPL3Q86UP9 236 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MREGQ8N565 214 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 FCAMRQ8WWV6 532 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM83DQ9H4H8 585 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ISPDA4D126 451 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CASTOR1Q8WTX7 329 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R10Q9NYW0 307 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CMAHPQ9Y471 501 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CIB4A0PJX0 185 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 H6PDO95479 791 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 WNT3AP56704 352 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CACNG1Q06432 222 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CLEC3AO75596 197 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GABBR2O75899 941 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CHIT1Q13231 466 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM184CQ9NVA4 438 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 H7C417 338 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CDK14O94921 469 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GPAT4Q86UL3 456 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PLK2Q9NYY3 685 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 HES2Q9Y543 173 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 UNC13BO14795 1591 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PEX2P28328 305 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP27C1Q4G0S4 372 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTD1Q8N815 330 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 NDC1Q9BTX1 674 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CFL2Q9Y281 166 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R50P59544 299 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SEMA3AQ14563 771 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC26A9Q7LBE3 791 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PWWP2AQ96N64 755 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 NEDD4LQ96PU5 975 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 TMX2Q9Y320 296 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 RAI2Q9Y5P3 530 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0J9YVX5 310 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SCGB2A1O75556 95 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNGR1P15260 489 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC23BQ15437 767 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CARD16Q5EG05 197 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 RELL1Q8IUW5 271 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MALSU1Q96EH3 234 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 NEO1Q92859 1461 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CLCA1A8K7I4 914 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MUSKO15146 869 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 EPHX1P07099 455 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PAX3P23760 479 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MPP1Q00013 466 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC66Q68CR7 880 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC19Q9H756 370 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MED14O60244 1454 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA10P01566 189 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 LIMK2P53671 638 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PEX13Q92968 403 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR21Q99679 349 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 J3QRK9 145 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-207ENST00000613246 MTPNP58546 118 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms