RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 C5orf60A6NFR6 353 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 OR51F1A6NGY5 319 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 SLC19A2O60779 497 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 PSMB4P28070 264 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 MARCKSL1P49006 195 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 NR2C2P49116 596 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 ZBED6P86452 979 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 CEP97Q8IW35 865 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 HES7Q9BYE0 225 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 C3orf18Q9UK00 162 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRS-208ENST00000590509 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 DYTNA2CJ06 578 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CFAP99D6REC4 459 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 MAP2K7O14733 419 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 RASAL1O95294 804 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CLDN14O95500 239 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM253P0C7T8 217 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 PSMB5P28074 263 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 GEMP55040 296 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CSNK1G2P78368 415 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 KIR2DS3Q14952 304 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 IQCB1Q15051 598 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ELMO1Q92556 727 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NRGNQ92686 78 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 FITM1A5D6W6 292 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 AP2A1O95782 977 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 TPH1P17752 444 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 COMTP21964 271 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NSG1P42857 185 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 INAQ16352 499 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 LRRC38Q5VT99 294 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 C3P1Q6ZMU1 363 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 MIEF2Q96C03 454 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 C10orf90Q96M02 699 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 MCCC2Q9HCC0 563 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ENAMQ9NRM1 1142 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 OR1I1O60431 355 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 USP1O94782 785 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 SERPINC1P01008 464 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 SERPINA7P05543 415 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 GRM7Q14831 915 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 PCOLCEQ15113 449 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 SLC18A3Q16572 532 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 GPR33Q49SQ1 333 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 HEXDCQ8WVB3 486 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 P3H4Q92791 437 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 VAT1Q99536 393 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 POLG2Q9UHN1 485 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 MEMO1Q9Y316 297 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 GTF3C1Q12789 2109 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 A0A0J9YVX5 310 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 HYKKA2RU49 373 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 IDSB3KWA1 339 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ADAM10O14672 748 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 BMP10O95393 424 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CRTAMO95727 393 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRS-208ENST00000590509 CAPN3P20807 821 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms