RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL1RNP18510 177 aa16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPN6P29350 595 aa16.03■□□□□ 0.16
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MMP12P39900 470 aa16.03■□□□□ 0.16
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