RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 OTX2P32243 289 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 GJC1P36383 396 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 CD86P42081 329 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 HCAR3P49019 387 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 LMAN1P49257 510 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 ARSEP51690 589 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 VAV2P52735 878 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 CTSCP53634 463 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 GBE1Q04446 702 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 GALNT2Q10471 571 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 BECN1Q14457 450 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 NFE2L1Q14494 772 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 LLGL1Q15334 1064 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 RPE65Q16518 533 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 KYNUQ16719 465 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 FGD2Q7Z6J4 655 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 MRGPREQ86SM8 312 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 DSELQ8IZU8 1212 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 IQCKQ8N0W5 287 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 D2HGDHQ8N465 521 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 NEK11Q8NG66 645 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 OR1L3Q8NH93 324 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 RAB33BQ9H082 229 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 OR5K3A6NET4 321 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 KCNK1O00180 336 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 MATN3O15232 486 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 LRRTM2O43300 516 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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PTPRM-206ENST00000578093 FERP16591 822 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 IDSP22304 550 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 SERPINB6P35237 376 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 CBSP35520 551 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 PCK1P35558 622 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 TAS2R40P59535 323 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 DCDC1P59894 354 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 KRTAP10-9P60411 292 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 UBE2HP62256 183 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-206ENST00000578093 TUBB4BP68371 445 aa3.82□□□□□ -1.8
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