RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		9.04	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		9.04	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		9.04	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CES2	O00748	559 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF185	O15231	689 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP5D	P30049	168 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PTGIR	P43119	386 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	BDKRB1	P46663	353 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	FNTA	P49354	379 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	ARSF	P54793	590 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CHAF1B	Q13112	559 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CTBP1	Q13363	440 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	GBX1	Q14549	363 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PPP1R7	Q15435	360 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TCTE1	Q5JU00	501 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	FCRL6	Q6DN72	434 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB43	Q86YS6	212 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	DLG3	Q92796	817 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	PTER	Q96BW5	349 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	GBP5	Q96PP8	586 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	GALP	Q9UBC7	116 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX12	Q9UMY4	172 aa		9.03	□□□□□ -0.96
KIFC3-231	ENST00000567479	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
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KIFC3-231	ENST00000567479	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479		A6NL46	340 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX12	O00623	359 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	OTX2	P32243	289 aa		9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	GRM7	Q14831	915 aa		9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		9.02	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GX78	115 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT87P	A6NCN2	255 aa		9.01	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	CEACAM4	O75871	244 aa		9.01	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
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KIFC3-231	ENST00000567479	CLCN7	P51798	805 aa		9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
KIFC3-231	ENST00000567479	FOXK1	P85037	733 aa		9.01	□□□□□ -0.97

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