RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 MTAPQ13126 283 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FADDQ13158 208 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 GBX1Q14549 363 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 IHHQ14623 411 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 MBTPS1Q14703 1052 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KIAA0040Q15053 153 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DGUOKQ16854 277 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CARD16Q5EG05 197 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RABL3Q5HYI8 236 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RTP2Q5QGT7 225 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FRG2Q64ET8 278 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CPZQ66K79 652 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR2T5Q6IEZ7 315 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TPGS1Q6ZTW0 290 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC00471Q8N535 108 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR2T29Q8NH02 315 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FNDC8Q8TC99 324 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LINC01599Q8WXQ3 324 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NR4A3Q92570 626 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RORBQ92753 470 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NELL1Q92832 810 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 MYDGFQ969H8 173 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TMBIM1Q969X1 311 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ALG14Q96F25 216 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 VMP1Q96GC9 406 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CRELD1Q96HD1 420 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FCRL1Q96LA6 429 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PPM1MQ96MI6 270 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 QRFPRQ96P65 431 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 VPS35Q96QK1 796 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FRG2BQ96QU4 278 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NODALQ96S42 347 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SEPHS2Q99611 448 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EPYCQ99645 322 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC30A3Q99726 388 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EHD1Q9H4M9 534 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 GALNT8Q9NY28 637 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KLQ9UEF7 1012 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 VPS51Q9UID3 782 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 YIPF1Q9Y548 306 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.87□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SH3D21A4FU49 640 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CLDN25C9JDP6 229 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RNF223E7ERA6 249 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 H0Y858 1186 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 M0R3G1 203 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CLIC1O00299 241 aa4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DLGAP1O14490 977 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms