RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 MGAT5Q09328 741 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 DNASE1L3Q13609 305 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CYP2A13Q16696 494 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PCSK4Q6UW60 755 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 GPR135Q8IZ08 494 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 KLHL20Q9Y2M5 609 aa24.43■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 C21orf140B9A014 251 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 TERTO14746 1132 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 F8A1P23610 371 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PSMB5P28074 263 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 GABRA4P48169 554 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 RGS4P49798 205 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CDKN2DP55273 166 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CDC20Q12834 499 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CBLBQ13191 982 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 GPS2Q13227 327 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 C8orf74Q6P047 294 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 GPATCH11Q8N954 259 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ZNF592Q92610 1267 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 WBP1Q96G27 269 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 LRFN5Q96NI6 719 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SAYSD1Q9NPB0 183 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 KCND3Q9UK17 655 aa24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 OR2B3O76000 313 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PRKAR1AP10644 381 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 TCN2P20062 427 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 MC1RQ01726 317 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 FAM45BPQ6NSW5 357 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CAPN12Q6ZSI9 719 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SLC38A9Q8NBW4 561 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PYROXD1Q8WU10 500 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ASB11Q8WXH4 323 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SLC39A7Q92504 469 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 EXTL1Q92935 676 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 MR1Q95460 341 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 MIPEPQ99797 713 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.41■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 A0A1W2PPV9 198 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ZNF839A8K0R7 811 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 HCRTR1O43613 425 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 CAV1Q03135 178 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 OR2L3Q8NG85 312 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PKP4Q99569 1192 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.4■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 ATMQ13315 3056 aa24.39■■□□□ 1.5
TCP1-217ENST00000546023 GFYI3L273 518 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 TK2O00142 265 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 NKX2-8O15522 239 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ZNF749O43361 778 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 ZBTB14O43829 449 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 KATNA1O75449 491 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 RORAP35398 523 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 HSD17B2P37059 387 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PNLIPRP1P54315 467 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PLTPP55058 493 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 CYHR1Q6ZMK1 362 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 DSELQ8IZU8 1212 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SMPDL3AQ92484 453 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 PSAT1Q9Y617 370 aa24.39■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 H3BMH7 237 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 MEN1O00255 615 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SLC16A8O95907 504 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 HBQ1P09105 142 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 FDXRP22570 491 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 SP140Q13342 867 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 NAA25Q14CX7 972 aa24.38■■□□□ 1.49
TCP1-217ENST00000546023 TBR1Q16650 682 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms