RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CCDC138Q96M89 665 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CDK15Q96Q40 435 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ECSITQ9BQ95 431 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TIMM22Q9Y584 194 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 C10orf142B7Z368 130 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OR7A17O14581 309 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 C1orf105O95561 183 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OTCP00480 354 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 IGHV4-34P06331 123 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ACP5P13686 325 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 EPB42P16452 691 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CCR5P51681 352 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 AQP4P55087 323 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MED21Q13503 144 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 NFATC4Q14934 902 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 METRNLQ641Q3 311 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 NXNQ6DKJ4 435 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PDZD3Q86UT5 571 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PJA1Q8NG27 643 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ATL1Q8WXF7 558 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GATA6Q92908 595 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FBXL8Q96CD0 374 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 BMFQ96LC9 184 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GPR174Q9BXC1 333 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CHRDQ9H2X0 955 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SLC32A1Q9H598 525 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MEAF6Q9HAF1 191 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FGF22Q9HCT0 170 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 DCXO43602 365 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ATP6AP2O75787 350 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OR4F21O95013 312 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 STAMBPO95630 424 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 APBB3O95704 486 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 UROSP10746 265 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 KELP23276 732 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 HTR1BP28222 390 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PEX2P28328 305 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ACADLP28330 430 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SLC6A12P48065 614 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.44□□□□□ -1.06
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THBS3-210ENST00000541576 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 RLN3Q8WXF3 142 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CLDN23Q96B33 292 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 C19orf60Q96EN9 201 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 HSPBAP1Q96EW2 488 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 KATNA1O75449 491 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 WDR47O94967 919 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CHEK2O96017 543 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GNPDA1P46926 289 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PFN3P60673 137 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 DMPKQ09013 629 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TRAF3Q13114 568 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SFT2D3Q587I9 215 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 MILR1Q7Z6M3 343 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 RNF148Q8N7C7 305 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 FRMD1Q8N878 549 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 PYCR2Q96C36 320 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS3-210ENST00000541576 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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