RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 GRID2O43424 1007 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 SSX9Q7RTT3 188 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RAB42Q8N4Z0 105 aa5.92□□□□□ -1.46
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